计算机应用研究

作者：费兆杰,刘培强,郭俊宏,杨壮,刘畅,

单位：1.山东工商学院a.计算机科学与技术学院;b.统计学院,山东烟台264005；2.山东省高等学校未来智能计算协同创新中心,山东烟台264005；

关键词：关键蛋白质,蛋白质相互作用网络,亚细胞定位,蛋白质复合物,

基金：山东省研究生教育质量提升计划资助项目(SDYKC19199)；山东省自然科学基金资助项目(ZR2017MF049)；烟台市重点研发计划资助项目(2017ZH065)；；

现有关键蛋白质识别算法对生物信息考虑不全面、识别准确率亦有待提高，针对此问题，提出一种高效关键蛋白质识别算法PDWS。首先，结合由亚细胞定位信息获取到的蛋白质位置和蛋白质相互作用网络边聚类系数构建加权网络；其次，依据蛋白质所处亚细胞位置，提出亚细胞定位区室子网参与度指标；最后，融合亚细胞定位区室子网参与度和蛋白质复合物子网参与度指标，多维度度量蛋白质关键性。在DIP和Krogan两个标准数据集上的实验结果表明，PDWS算法性能优于PeC、PCSD等已有算法，可识别出更多特定结构的关键蛋白质，且识别精度分别达到0.76与0.73。

来源：2022年第1期

《计算机应用研究》期刊编辑部

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