计算机应用研究

北大核心,JST,Pж(AJ),CSCD扩展版,WJCI

国内刊号:51-1196/TP

国际刊号:1001-3695

计算机应用研究杂志2024年第7期:基于强化学习的离散层级萤火虫算法检测蛋白质复合物

发布日期:

作者:张其文,郭欣欣,

单位:兰州理工大学计算机与通信学院,兰州730050;

关键词:蛋白质复合物,萤火虫算法,强化学习,层级学习策略,局部搜索策略,

基金:国家自然科学基金资助项目(62063021,62162040);;

蛋白质复合物的检测有助于从分子水平上理解生命的活动过程。针对群智能算法检测蛋白质复合物时假阳/阴性率高、准确率低、种群多样性下降等问题,提出了基于强化学习的离散层级萤火虫算法检测蛋白质复合物(reinforcement learning-based discrete level firefly algorithm for detecting protein complexes,RLDLFA-DPC)。引入强化学习思想提出一种自适应层级划分策略,动态调整层级结构,能有效解决迭代后期种群多样性下降的问题。在层级学习策略中个体向两个优秀层级学习,避免算法陷入局部最优。为了提高蛋白质复合物检测的精度,结合个体环境信息提出自适应搜索半径的局部搜索策略。最后,在酵母蛋白质的4个数据集上,与8种经典的蛋白质复合物检测方法进行对比,验证了该方法的有效性。

来源:2024年第7期

《计算机应用研究》期刊编辑部

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